基层医疗卫生机构实行基本药物零差率销售后，人员经费、业务经费等运行经费，将通过服务收费和政府补助予以补偿。基本医疗服务收费，主要通过提供基本医疗服务，由医疗保障付费和个人付费补偿；基本公共卫生服务，主要通过城乡公共卫生服务经费补偿。

　　政府补助按照“核定任务、核定收支、绩效考核补助”的办法核定，对于核定后的经常性收支差额，由县级政府统筹上级财政有关补助后，在预算中足额安排。