汉置东阿县，属东郡。

三国时期为魏地，隶属同汉。

西晋属济北国；东晋改国为郡，东阿属之。

南北朝时期，因南北分裂，政权迭易，457年东阿并入谷城县。

后魏，恢复东阿县。

北齐省谷城，入东阿，属济州。

隋朝，东阿属兖州济北郡。

621年（唐武德四年），属济

州，隶河南道。

742年（天宝元年）更州为郡，隶济阳郡，同年恢复谷城县。

754年改属郓州东平郡。

766年（大历元年），郓州改为淄青道，东阿属之；819年，郓州属天平郡，东阿随之改隶。

五代十国时期，东阿属郓州天平节度使。

宋初，属京东路；1041年（庆历元年）置西路安抚使，东阿随郡改隶；1115年郡升为大都督府，1127年改为东平府，东阿均属之。金代，隶山东西路东平府。

元初，隶东平路。1272年，东平改为下路总管府，司六县，东阿属之。

明初属于东平府，1375年（洪武八年）隶济宁府东平州，1385年改属兖州，隶山东布政使司。

清初，属兖州府东平州；1735年（雍正十三年）改属泰安府。

1912年（民国元年），东阿隶山东东临道。

1932年，东阿与阳谷邻界的部分村庄作了调整。

1928年废道直隶山东省府。

1936年隶山东省第六督察专员公署。

1940年县人民政权建立后，隶鲁西行署运东专署（第四专署）。

1941年7月，鲁西行署和冀鲁豫行署合并，成立冀鲁豫行署，下辖7个专署，东阿隶第四专署。

1942年12月，冀鲁豫行署一、四专署合并为一专署，东阿属之。

1945年8月，日军投降后，隶冀鲁豫行署第六专署。

1949年8月，隶平原省聊城行政督察专员公署。

1952年11月平原省撤消，东阿随聊城专署该隶山东省。

1958年12月，东阿建制撤消，各公社分别并入寿长、茌平两县。

1961年7月恢复东阿县，其隶属未变。

1967年专区改为地区，东阿属山东省聊城地区行政公署。