（1）化肥优点是养分含量高，肥效快，增产效果显著。缺点是养分较为单一，通常需要几种肥料配合施用；养分释放速度快，纵向平衡供应能力较差；易经挥发、淋溶、固定等途径损失，肥料利用率不高；酸、碱、盐性强烈，施用不当，不仅对植物生长不利，还可能使土壤变劣，降低土壤肥力。

　　（2）有机肥一种完全肥料，含有丰富的有机质和植物所需的多种营养元素。有机肥还是非常优秀的土壤改良、地力培肥剂，对改善土壤结构、提高土壤养分容量、增强土壤保肥保水能力、调节土壤酸碱度、促进土壤微生物活动、提高土壤养分有效性等都具有良好的作用。缺点是养分浓度低，供肥缓慢，因而增产效果不如化肥显著。

　　（3）菌肥以活的微生物为有效成分的肥料，包括根瘤菌肥、固氮菌肥、磷细菌肥和钾细菌肥等。菌肥自身并不是植物的养分，但其具有固定空气中的游离氮素或活化土壤中植物难以利用的无效磷和钾等的功能，因此可以减少相应营养元素的施肥量。由于菌肥由活菌构成，通常忌阳光直射和与农药混施，对土壤温度、湿度、酸碱度、有机质含量等环境条件的要求亦较为严格。