酸碱度通常以氢离子浓度的负对数即pH值来表示。环境中的pH值对微生物的生命活动影响很大，主要作用在于：引起细胞膜电荷的变化，从而影响微生物对营养物质的吸收；影响代谢过程中酶的活性；改变生长环境中营养物质的可给性以及有害物质的毒性。

　　每种微生物都有其最适pH值和一定的pH范围。在最适范围内酶活性最高，如果其它条件适合，微生物的生长速率也最高。大多数细菌、藻类和原生动物的最适pH为6.5-7.5，在pH4-10之间可以生长；放线菌一般在微碱性即pH7.5-8最适合；酵母菌、霉菌则适合于pH5-6的酸性环境，生存范围在pH1.5-10之间。

　　专用生物肥中的有效活菌是取自于目标植物根际的。只要是适宜目标植物生长的土壤环境，就适宜专用生物肥中有效活菌的活动，这也是专用生物肥效果稳定的原因。