错那藏语意为“湖的前面”。

吐蕃王朝时期，错那一带属约茹所辖。

元朝时属扎由瓦万户府领辖。

约公元14世纪，帕竹地方政权在错那建宗。

民主改革前，错那宗属洛喀（山南）基巧管辖，而门隅的大部分地区则在20世纪上半叶中印战争后一直被印度非法侵占。

1959年5月5日错那县人民政府成立，隶属山南专区（地区）管辖至今，县府驻错那。

1959年成立雪下乡、觉拉乡、扎洞乡、吉松乡、卡达乡、库局乡、曲卓木乡、廓麦乡、兰普乡、洞嘎乡；1959年勒布区建区（区公所驻地麻玛乡，西边和南边与不丹接壤，为中国门巴族主要聚属区），建区时辖麻玛乡、贡日乡、勒乡、色木乡、吉巴乡5个乡。

1962年5月从江孜地区划归山南地区。

1962年6月觉拉乡、扎洞乡、卡达乡由隆子县划归错那县。

1970年，觉拉乡、扎洞乡、卡达乡、洞嘎乡、廓麦乡、兰普乡、麻玛乡、贡日乡、勒乡、色木乡、吉巴乡建公社，1988年复改乡。库局乡于1970年改公社，1987年复改乡。曲卓木乡于1969年改公社，1987年复改乡。雪下乡于1970年改错那公社，1988年改乡。吉松乡于1970年改青山公社，1988年复改吉松乡。

1997年，面积34872平方千米（其中包括被印度非法占领的“麦克马洪线”以南的门隅地区），实际控制面积10405平方千米，1个区（勒布区），14个乡（错那乡、觉拉乡、扎洞乡、吉松乡、卡达乡、库局乡、曲卓木乡、洞嘎乡、兰普乡、廓麦乡等），68个村。

2000年，错那县辖1个镇、5个乡。

2004年辖1个区公所，14个乡，67个村。

2005年辖：错那乡、觉拉乡、扎洞乡、吉松乡、曲卓木乡、卡达乡、库局乡、洞嘎乡、兰普乡、廓麦乡、勒布区。

2016年2月，山南撤地设市，此县属于山南市。