和其他外科手术一样，正颌外科术后也会因为各种原因导致一些并发症如呼吸道梗阻、出血、血肿、颈动脉闭合伤、颅神经功能障碍、组织坏死、伤口愈合不良、感染、关系及功能异常、颞下颌关节病症、美容效果不佳、心态异常及不同程度的牙颌面畸形复发等，严重者可导致失明。但是这些并发症都是可以预防的。