（1）躯体疾病：有些躯体疾病在早期可能难以找到客观的医学证据，因此，各类躯体形式障碍的诊断要求病程至少要3个月以上，有的甚至要求2年以上，以便自然排除各类躯体疾病所引起的躯体不适。临床上，对年龄超过40岁而首次表现躯体不适为主要症状者，一定要谨慎，不要根据患者有心理诱因、初步检查未发现阳性体征、有一定的暗示性等就轻易做出躯体形式障碍的诊断，而要仔细观察，以免误诊、误治。

　　（2）抑郁症：抑郁症常伴有躯体不适症状，而躯体形式障碍也常伴有抑郁情绪。鉴别时一方面要考虑症状发生的先后，另一方面，要分析症状的特性。重性抑郁患者还有一些生物学方面的症状，如早醒、晨重夜轻的节律改变、体重减轻及精神运动迟滞、自罪自责、自杀言行等症状，求治心情也不如躯体形式障碍者强烈，而药物治疗效果较好等可予以鉴别。

　　（3）精神分裂症：早期可有疑病症状，但其内容多离奇、不固定，有思维障碍和常见的幻觉和妄想，患者常不主动就医，对自身疾病无认识能力。

　　（4）其他神经症：各种神经症均可出现躯体不适或疑病症状，但这些症状均为继发性的，也不是主要的症状。