除特发性青春期发育延迟外，其他病变引起的青春期延迟有高促性腺激素性性腺功能减退和低促性腺激素性性腺功能减退两大类。前者病变在性腺，包括各种原因引起的睾丸发育不全或功能衰竭，血浆黄体生成素（LH）、卵泡刺激素（FSH）水平显著增高。后者病变主要在下丘脑（如Kallmann综合征等）或垂体（如垂体或鞍上区肿瘤等），虽然都引起LH和FSH水平的降低，但是由于垂体受损的程度不同，因而其降低的程度和对GnRH的反应程度存在不均一性。