由于肾小管间质性肾炎病因多样，许多原因不明的肾小管间质性肾炎常存在自身免疫性因素，包括细胞免疫及体液免疫。它们以循环抗肾小管基底膜抗体阳性为特征，肾活检在肾小管基底膜上可见IgG，C3线样沉积，不伴有肾小球基底膜疾病。有人把这类肾小管间质性肾炎称作抗TBM抗体病。