一、镰刀菌苗枯病
该病在高温、多湿条件下，易流行发生。其发生与种子带菌相关，且小粒玉米种子相对较重。同时，沙质土壤、有机质含量低、土壤板结较重和重氮肥、少磷钾肥地块相对较重；播种过深、出苗期延长，也相对严重。从种子萌芽到3～5叶期的幼苗多发，病芽种子根变褐腐烂，且可扩展到中胚轴，严重时幼芽腐烂死亡。幼苗的初生根皮层坏死，茎基部呈水浸状腐烂，可使茎基部节间整齐断裂（注：这是与纹枯病的区别）。病苗发育迟缓，生长衰弱，严重时全株叶片黄枯或青枯。
防治措施：对于发病地块，可用25.9%回生灵（络氨铜?络锌?柠铜水剂）20毫升、50%多菌灵30克（注意选用高质量的产品）、“E导素”40克（含芸苔素、萘乙酸的全元素营养调节剂）、英国进口的70%“禾丰锌”（Kingfolzinc）9毫升或25%“威力锌”15克混合液叶面喷施，对局部苗弱的应重点喷施根基部（用量以容量12.5公斤的喷雾器为准，下同）。间隔5～7天喷一次，连喷2次为宜。
二、全蚀病
苗期和成株期都可发病，但主要是以苗期侵染为主（如果苗期防治不及时，则往往在灌浆乳熟期大发生，损失严重）。苗期虽根部发病，但由于玉米的次生根不断再生，地上植株表现症状不是很明显，只是表现为相对苗黄苗弱、生长较慢，这一点需要特别注意（重点观察根部）。在上茬小麦发病较重以及有机质含量少、使用钾肥不足的地块，发生较重。高温、高湿利于该病的流行大发生。
防治措施：同上。
三、纹枯病
近年来，随着紧凑型玉米品种的大面积推广，密植、高肥种植的发展，以及多年连作，纹枯病发生渐趋严重。特别是上茬小麦的纹枯病较重，以及在温度高、降雨多、湿度大的条件下，该病发生相对严重。发病田一般减产10%～35%，严重的减产50%以上。从苗期到穗期均可发生，最早由植株底部1～2节叶鞘开始发病，逐渐向上发展。叶鞘上病斑最初呈“水浸状”、椭圆形至不规则形、淡褐色或黄色。多个病斑汇合连片后，形成大型“云纹状”斑块（边缘“褐色”、中部“枯黄色”或“枯白色”）。病斑向上可扩展到果穗，使穗轴、籽粒变褐腐烂，果穗的苞叶上也形成“云纹状”病斑。
防治措施：在发生初期，选用以下农药喷雾防治：
①5%井岗霉素（Validamycin）25克+25.9%回生灵（络氨铜?络锌?柠铜水剂）20毫升。
②80%乙蒜素（Ethylicin）10毫升+50%多菌灵30克。
③50%多菌灵30克+5%井岗霉素25克。在用药的同时，选用“叶面锌肥”、“E导素”40克、“绿叶素”（多元素微肥）25克、“多得”（含稀土、硒的全元素叶面肥）50克等营养调节剂混合喷施，可促使植株健壮，效果明显。
特别提醒：在防治用药时，有人推荐使用20%三唑酮（百菌酮、粉锈宁、百理通，英文通用名称：Triadimefon），12.5%特谱唑（速保利、烯唑醇、禾果利，英文通用名称：Diniconazole），但在实际应用中，这两种“三唑类杀菌剂”对玉米幼苗有明显的抑制作用，建议避免采用为好。