一、药物损失问题。玉米种子从包衣生产出来到销售，一般要经历半年以上时间，在储存运输的过程中包衣的药剂会发生脱落、分解、失效，导致药物成分含量降低；玉米种子包衣后在运进仓库存储、包装、运输等过程中会造成已包衣的药物脱落，同样造成药物成分含量降低，导致药效降低。

　　二、安全性问题。包衣的药剂长时间接触种子会对种子造成伤害，影响出苗率。玉米种子从生产出来到销售需要半年以上的时间，如果选用高浓度的药剂进行包衣，会明显影响玉米种子的出苗率，所以种子企业为了不影响玉米种子的出苗率，会对包衣药剂的浓度进行慎重的选择。

　　三、防虫防病性问题。目前市场销售的玉米种子，虽然大都进行了包衣处理，但是区域针对性不强，储运过程中包衣药物降解和脱落，会造成药剂有效成分含量不足，所以造成买到的包衣种子不能很好地解决地上地下害虫和苗期病害。