秦武公十年（前688年），秦伐邽、冀戎于今天水、陇西一带，获胜后迁其部分邦民于今渭南市临渭区之渭河以北，设下邦县；县治在今巴邑镇。此为中国最早所置三县之一。

秦代，行郡县之制，置下邽县。

西汉，下邽县之外，东北处设莲勺县，后并入下邽县。

北魏太祖道武帝拓跋珪登国元年（386年）建朝后，发现下邽的邽与他名字中的“珪”同音，为了避讳朝廷便下令改念“邽”gui（归）为“吉”音。后又改下邽为下封，但仍念“下邽”的音。

隋代大业二年（606年），恢复“下邽县”的原写法，并恢复“邽”字原读音gui（归），还原了“下邽”的本来面目。隋大业十一年（615年），下邽县迁至今下邽镇址。

唐代至五代，下邽县隶属华州华阴郡。

宋代熙宁六年（1073年）不作县，只作镇，至元丰元年（1078年），下邽又复作县存在。

明洪武十四年（1381年），下邽县制被撤销，并入渭南县。

清朝初期，设下邽镇，隶属渭南县。

解放后，设下邽区人民政府；1955年改为乡政府；大县时改为下邽管区；1958年改为人民公社；文革时改为革委会；1978年将下邽更名为下吉；1984年撤乡改镇为下吉镇；2002年撤乡并镇，将原南七乡并入下吉镇；2011年元月，将原周家乡并入下吉镇。

2012年01月09日，下吉镇复名为下邽镇，政府驻地迁至双官路，行政区域和隶属关系不变。