3世纪中国的历史学家陈寿在其著作中记载这一地区生活着挹娄人。

5世纪挹娄改称勿吉，又改称靺鞨。

7世纪靺鞨诸部形成渤海国，但黑龙江流域的黑水靺鞨部单独建国。

11世纪契丹人统治这一地区。

12世纪靺鞨人的后代女真人在首领完颜阿骨打的带领下建国。

13世纪蒙古占领这一地区。

14世纪蒙古势力被驱逐，女真诸部落臣服于明朝。

16世纪女真人的英雄努尔哈赤统一女真诸部，其子多尔衮在1644年进入山海关，经过几年的战争满洲人

（努尔哈赤之子皇太极改女真为满洲）完全占领整个中国，成为中国历史上最后一个世袭王朝——清朝。

17世纪俄国和清朝就这一地区的主权问题发生争端，经过数场战斗以后，于1689年签订尼布楚条约，该地区归属清朝。

19世纪俄国再次入侵该地区，1858年《瑷珲条约》当中该地区被割让给俄国。

1861年3月26日，俄罗斯宣布阿穆尔州为开放自费定居。

20世纪开始，由于殖民人口的关系，定居民在阿穆尔盆地。

1900年，在阿穆尔河地区居住3438个流民。

1920年4月，远东共和国，凭借其在赤塔的资本，从阿穆尔河，贝加尔，堪察加半岛，库页岛，和滨海地区作为一个民主的“缓冲”状态而形成，以避免与日本的战争。直到1922年11月，阿穆尔州加入了俄联邦政府。

1926年1月，阿穆尔州成为哈巴罗夫斯克边疆区，随后将哈巴罗夫斯克和滨海边疆区划分哈巴罗夫斯克边疆区领土。

1948年，阿穆尔州从哈巴罗夫斯克边疆区分离出来，成为俄联邦政府一个独立的区域。

60至80年代犹太州的经济具有稳定向上的特征。建设新的工业企业，改造现有的企业。

1990年12月在俄联邦社会主义共和国第三届人民代表大会上对宪法有关俄联邦行政划分条文进行了修改。宣布从今以后犹太自治州直接成为俄联邦的组成。

1991年10月29日犹太自治州人代会通过了关于犹太自治州国家法律地位的宣言。

1991年以俄联邦社会主义共和国最高委会主席团命令的形式将犹太自治州从哈巴罗夫斯克边区分离出来，成为俄联邦的独立主体。

1992年3月31日签署了关于在国家政权联邦机构与犹太自治州政权机构之间客体与全权划分的联邦合约。