196年（汉建安元年）置侯官县， 属会稽郡南部都尉。三国吴时，隶属建安郡。 282年（晋太康三年）侯官析置原丰县、温麻县，三县同属晋安郡。 502—519年（南朝梁天监中年间）侯官、原丰合并为东侯官。589年（隋开皇九年）复名原丰。 592年（隋开皇十二年）改名闽县，属建安郡。623年（唐武德六年）闽县析置侯官、长溪、新宁（长乐）、温麻（连江）县。公元631年（贞观五年）侯官又并入闽县。702年（武周长安二年）复置侯官县。766年（永泰二年）划侯官西部地置永泰县。785年（贞元元年）划北部地置梅溪场（后为闽清县）。808年（元和三年）侯官并入福唐县，810年（元和五年）复置侯官县，闽县和侯官县同属福州。闽国年间 （933年）改闽县为长乐县，侯官县为闽兴县。935年，长乐、闽兴复名闽县、侯官县。941年，闽县再改称长乐县，翌年又恢复原名，此时两县皆隶于长乐府。

981年（宋太平兴国六年）闽县析置怀安县，侯官、闽县、怀安三县同属福州。元属福州路。公元1580年（明万历八年）怀安县并入侯官县，自此闽县、侯官两县并立，同属福建 宁福道福州府。

民国元年(1912年)，闽县、侯官县政区仍沿袭

区划。5月5日，闽县、侯官县裁撤归并，称闽侯府，原两县一切事务均归闽侯府接收管理。

闽侯府印信于12日启用，福州府印信于同日作废。

同年11月，闽县、侯官县印又重新启用。 民国2年3月废府，闽县、侯官县再次合并为闽侯县，辖地范围不变。取两县原名首字定名为闽侯县，闽侯由此而得名。

1946年,民国35年，析县治部分区域设福州市政筹备处，从此县市分治。

1944年改名林森县。

1949年9月隶属福建省第四专区，1950年复名闽侯县，属闽侯专区。

1956年3月直属福建省辖，8月改属福州市（或说，1958年属福州市）。

1959年复属闽侯专区，　闽侯又归其管辖， 1970年改专区为地区，同年6月，闽侯地区移驻莆田，改称莆田地区。　 1970年，闽侯县改隶莆田地区。

1973年6月5日至今，闽侯县划到福州。

民国23年9月，闽侯县营前等的六里的光裕、高详、钦仁、江左、绍惠、至德划到 长乐县。

民国25年， 闽侯县琯头8乡及川石、壶江2乡划到连江县。

民国29年，小箬、大箬、安仁溪、大溪、北溪、马洋、樟洋、石郑划到闽清县。

民国32年，小箬又划回闽侯县。

民国35年1月划县城区设福州市。

县治先后设于福州西涧、闽侯义序、尚干、螺洲，1970年县人民政府驻地由螺洲镇迁至甘蔗镇。

闽侯原闽县部分宋时分为12都，元、明两代分为凤池西、凤池东、晋安东、晋安西、高盖南、高盖北、崇善东、崇善西、开化东、开化西、赞贤、安仁12都，清代仍沿其旧；侯官县部分宋、元、明、清均为桂枝、东孝悌、西孝悌、胜业、修仁、永安、东太平、西太平、石门、五芝10乡；怀安县部分宋时分为感应、崇业、灵山、八座、承平、移风、积德、侯官、同乐东、同乐西10乡，元代仍沿其旧。

民国24年并为鼓山、南港、凤山、大湖4区。

民国34年区署撤销，辖27个乡（镇）。

1949年划为开闽、马江、闽亭、扈屿、尚干、南港、南屿、侯官8镇和松鼓、双岳、平远、西豹、净屏、金山、凤冈、小南、穆源、桐口、九凤、关源、甘蔗、白沙、洋箬、大湖、双大、双湖、义序、螺洲、四维、城门、永胪、嘉登、凤港、江滨、竹岐、东汶、大北、小北、江南、江北33乡。

1949年9月隶属福建省第四专区

1949年12月，从福建省 第四专区 闽侯县 划西豹、净屏、双岳、松鼓、江南、江北，白湖、双湖、平远、开闽等乡划到福州。

1952年12月，从第四专区 闽侯县划出鼓山、洪山、盖山、新店等到福州，隶属福州市人民政府郊区行政办事处。

此时今郊区所辖的建新、琅歧、亭江、城门和岭头、宦溪、红寮等乡镇仍隶属于闽侯专区 闽侯县。

1956年划为城门、马尾、南屿、白沙、尚干、雪峰、石牌7个区。　1957年11月撤销郊区行政办事处，原所辖的18个乡镇调整为10个乡镇，属福州市人民委员会。

1958年9月，恢复建制，称福州市郊人民公社管理委员会，1959年7月改为福州市人民委员会郊区行政办事处，其隶属不变。

1960年3月，郊区行政办事处撤销，鼓山、新店分别成立区人民委员会，隶属福州市。

洪山公社分解划属鼓楼区和台江区，盖山公社划属仓山区。

1962年1月郊区行政办事处恢复后，上述区、社归其管辖。此后，在今郊区辖区内曾先后设立过郊区革命委员会、北峰区革命委员会、蔬菜区革命委员会(后改名为环城区人民政府)、郊区人民政府，均隶属于福州。

1955年5月，从闽侯专区 闽侯县划 义序、吴山，盘屿、阳岐划到福州。

1956年6月，县石牌区贵洋乡丹洋村划到福州。

1958年4月，永泰县叶洋乡划 到闽侯县。

1956年3月，闽侯专区撤销，闽侯县直属福建省。

1958年11月5日，改由福州管辖。

1958年实行人民公社化，划为18个人民公社。

1959年8月8日，闽侯专区恢复，闽侯又归其管辖。

1970年，闽侯县改隶莆田地区。

1973年6月5日至今，闽侯县改隶福州市。

1960年1月，从闽侯专区 闽侯县划 县马尾公社 到福州。

1961年11月，从闽侯专区 闽侯县划 县建新、亭江、琅岐、北峰4个公社划到福州郊区。

1970年改专区为地区，同年6月，闽侯地区移驻莆田，改为莆田地区。

1970年6月，从莆田专区 闽侯县划城门公社到福州市朝阳区(即仓山区，原郊区1970年2月撤销)。

1983年划为14个人民公社1个镇。

1984年实行政社分开，各公社分别改为乡（镇），共设4个镇11个乡，后又增设小箬乡，并陆续将5个乡改镇。

2000年，闽江乡划出公婆、胜利、建星、闽亭、建亭5村归马尾区。闽侯县辖甘蔗、白沙、荆溪、上街、南屿、南通、祥谦、尚干、青口9个镇，廷坪、洋里、小箬、大湖、鸿尾、竹岐、闽江7个乡，设7个居委会、311个村委会。

2003年，闽侯县辖9个镇、7个乡：甘蔗镇、白沙镇、南屿镇、尚干镇、祥谦镇、青口镇、南通镇、上街镇、荆溪镇、竹岐乡、鸿尾乡、洋里乡、大湖乡、廷坪乡、闽江乡、小箬乡。

2004年，全县辖9镇7乡，323个村（居），总人口61.5万。

2005年2月5日，撤销闽江乡，闽江乡并入祥谦镇。合并后的祥谦镇辖泮洋、兰圃、枕峰、凤港、琯前、双龙、洋下、岐尾、澜澄、山后、辅翼、卜洲、三溪口、门口、萧家道、禄家、中院、江中、峡南、新建20个村委会，镇人民政府驻地不变。9月27日，撤销闽侯县甘蔗镇建制，设立甘蔗街道办事处，原甘蔗镇的行政区域为甘蔗街道办事处的行政区域，甘蔗街道办事处驻原甘蔗镇政府所在地五福村。2005年，闽侯县辖1个街道、8个镇、6个乡：甘蔗街道、白沙镇、南屿镇、尚干镇、祥谦镇、青口镇、南通镇、上街镇、荆溪镇、竹岐乡、鸿尾乡、洋里乡、大湖乡、廷坪乡、小箬乡。