以流经城区的龙津河取名。后晋时为宁化麻仓里清流驿。宋属折桂乡，清道光间称坊郭里。

民国20年（1931）7月6日，清流县工农革命委员会设于镇内。

民国34年改为城厢镇，设8保。

1950年2月仍为城厢镇。

1953年镇撤销，为第一区驻地。

1958年改称城关公社。

1973年由城关公社划出成立街道办事处，1981年10月经福建省政府批准将城关公社的2个居委会和渔沧大队划出设龙津镇。

1990年辖2个居委会、3个村委会、24个村民小组，镇区面积3.14平方千米，人口13412人。

1997年，面积33.2平方千米，人口1.8万，辖城南、城东、蔬菜3个村委会和渔沧、翠园、凤翔、长兴4个居委会。2006年撤销东华乡并入龙津镇。