燕郊因春秋战国时期地处燕国城郊而得名，唐宋以来，借助潮白河（箭杆河）码头和京榆古道，商贾云集，店铺林立。旧镇西建有天齐庙（东岳庙）。每年农历三月二十八日为天齐庙会，届时万人空巷，热闹非凡。清康熙初年，在镇北建造燕郊行宫，为帝后出京东巡，拜竭东陵第一站。

解放前，旧政权大部分属通县二区，小部分属三河县四区；1950年至1957年属三河县四区；1958年人民公社化运动后属三河县红星人民公社，1962年划为小公社后，分别为燕郊人民公社、中赵甫人民公社、马起乏人民公社；1983年经济体制改革后改称燕郊镇；同年3月，被三河县批准为首批建制镇；1992年燕郊经济技术开发区从燕郊镇析出另建；1996年撤乡并镇后辖53个行政村，2003年区（镇）一体化后辖55个行政村。