拜泉镇名来源于拜泉县名。原名“巴拜泉子”，俗称“大泡子”。清代中叶后，为依克明安旗游牧之地。

，1906年（清光绪三十二年）划归拜泉县管辖。

1908年11月（清光绪三十四年十月），拜泉县署自三道沟子（今三道镇）移驻大泡子（今拜泉镇）新建县署。大泡子地方遂为县城。中华民国时期，为拜泉县城区。东北沦陷后，初为第一保，1938年5月改为拜泉街。

1945年“九三”抗日战争胜利后，1946年为县城区，1951年改为第一区。

1955年称大泡子镇，同年，因系县政府驻地，改为拜泉镇。

1958年9月，改称跃进人民公社，1960年改为拜泉镇公社。

1980年10月，改称拜泉镇。