自1994年10月10日国务院批准将湛江市郊区更名为麻章区，下辖麻章、湖光、太平3个镇。2000年，麻章区辖7个镇：麻章镇、太平镇、湖光镇、东山镇、东简镇、民安镇、硇洲镇。

2002年，麻章区辖7个镇（东简、东山、硇洲、民安、湖光、太平、麻章），114个村委会、12个居委会。

截至2005年12月31日，麻章区辖7个镇（麻章、东简、东山、硇洲、民安、湖光、太平）。

2006年，将东海岛经济开发区代管的东山镇、东简镇改为湛江经济技术开发区东海岛新区代管。