西柯镇自西晋太康三年（公元282年）设置厦门同安县以来，行政区划都隶属同安。

宋代以后，主要区域都属永丰乡从顺里，

民国29年（公元1940年）划为第一区，定名为瑶岗乡，后更名为康乐乡，

1959年2月，改为策槽公社，

1984年，因乡政府驻地在西柯村，遂改名为西柯乡，

1991年12月，撤销西柯乡，设立西柯镇。