新干县境，先秦时期，为上淦。

秦朝，始皇二十六年（前221 年）建县。

西汉，高帝四年（前203年）设南部都尉驻淦，分管郡南诸县。

新朝，始建国二年（9年），王莽曾改县名为偶亭。

东汉，和帝永元八年（96年）析新淦、庐陵各一部分合置石阳县。

三国，东吴后主宝鼎二年（267年）再析新淦分置巴邱县。

隋朝，文帝开皇十年（590年）迁县城至南市村（今金川镇）。

五代十国，天佑七年（910年）设都制置使驻淦，辖吉水、新喻、丰城三县。

南唐，升元二年（938年）析崇学乡，与高安县的建安、修德两乡，合置清江县。

南宋，绍兴三年（1133年）至绍兴十三年（1143年）间，抗金名将岳飞、韩世忠、梁红玉均驻淦练兵习武，屯兵设防。

元代，成宗元贞元年（1295年）曾升县为州。

明朝，嘉靖五年（1526年）析28个都，分置峡江县。

民国二十一年（1932年）江西省第一行政督察专员公署设新淦，管辖南昌、新建、进贤、安义、高安、丰城、清江八县。

中华人民共和国成立后，初属南昌分区专员公署；1952年9月改属吉安专区；1957年改县名为新干，属吉安地区。