藤县，秦以前属百越地。公元前214年（秦始皇三十三年）属南海郡，郡治番禺（今广州）。汉初属南越国地。

公元前111年（汉武帝元鼎六年属苍梧郡猛陵县地，县治今苍梧县境。王莽新朝，苍梧郡曾改名新广，猛陵县改名猛陆。

三国属吴，为苍梧郡猛陵县地。

公元361年（晋穆帝升平五年）属永平郡安沂县。

南朝宋属永平郡安沂、丰城、夫宁县。南朝齐仍属永平郡夫宁、安沂。南朝梁于永平郡置石州，属石州。南朝陈属永平、建陵郡。

隋平陈废永平郡。公元590年（开皇十年）置石州，592年改名藤州。607年（大业三年），复以藤州为永平郡，属永平、安基、隋安、淳人，治永平县（即南朝齐夫宁县，开皇中改名）。公元618年永平郡属梁。

公元621年（唐武德四年）改永平郡为藤州，领永平、安基、武林、隋建、阳安、普宁、宁人、淳人、猛陵、大宾、贺川、戎城等县，624年，淳人更名感义；贞观时改名镡津，为藤州治所。

627年（贞观元年）属容州总管府。742年（天宝元年）改名感义郡。758年（乾元元年）复为藤州，辖镡津（原永平县）、感义、义昌、宁风县。

五代十国，仍为藤州。初属楚，后属南汉。宋仍为藤州。972年（开宝五年）省宁风、感义、义昌入镡津。973年州治西移一公里至绣江西岸（今藤城镇驻地），1071年（熙宁四年）隶广南西路。

元属藤州镡津县，隶湖广行省；1341～1368年末隶湖广行中书省。

明属梧州府，1369年（洪武二年）9月，省镡津县入藤州。1377年5月降州为县，始名藤县。清藤县属梧州府。

民国初废府设道，1913年2月，藤县属梧州道，7月设郁江道，属郁江道。

1914年6月郁江道易名苍梧道，藤县属之。

1935年3月，属梧州行政监督区，1941年4月改为梧州行政督察区，区治梧州市，藤县属之，至解放。

解放后，藤县属广西省梧州专区。

1950年2月，全县划分为6个区，辖29个乡、2个镇。

1951年2月划分为12个区。

1951年5月划糯垌归岑溪，7月梧、郁专区合并改名为容县专区。

1953年3月，划三堡区归岑溪县，全县设166个乡、3个镇，区为县派出机关，共10个区；乡镇为一级政权组织。

1955年5月第一至第十区依次改名为城厢、赤水、埌南、大坡、大黎、象棋、金鸡、天平、濛江、太平区。

1958年1月1日撤区并乡，全县划分为44个乡，保留大黎区（辖8个乡）、太平区（辖11个乡）；5月撤销区，全县调整为31个乡；7月，原梧州专区恢复，藤县属辖区内；8月撤乡镇，成立12个人民公社。

1959年4月后，分出18个人民公社，下设大队，大队下设生产大队。

1961年5月，全县划为6个区，区辖42个公社（时称中等公社），公社下辖684个大队。

1962年10月，全县划为14个区、1个镇，区以下设乡，乡社合一，每乡一社（小公社），共200个小公社。

1968年11月改区为公社，乡改称大队。

1969年8月，从城关分出白沙，金鸡分出新庆，大黎分出宁康，埌南分出同心，藤城镇改称藤城人民公社，共19个公社。

1971年11月，梧州专区改称梧州地区。

1980年8月，太平公社又分出太平镇公社。

1984年8月，南安公社分出赤水，同月各人民公社改称乡、镇，11月白沙改称津北乡，时全县共21个乡镇。

1987年1月，太平乡和太平镇合并称太平镇。

1990年全县辖9乡、11镇、265个村公所、1186个村委会、4201个自然村。

1997年，城关乡改称潭东镇，新庆、同心、津北、东荣乡改称镇，1997年4月，隶属梧州市。

2001年，全县辖藤城、潭东、南安、埌南、津北、金鸡、象棋、同心、岭景、新庆、天平、濛江、和平、太平、古龙、东荣、大黎17个镇，赤水、宁康、平福3个乡；村民委员会266个，居民委员会13个。2002年4月，南安镇与赤水乡合并，设立塘步镇，全县辖17个镇，2个乡。2003年7月，撤销宁康乡，设立大黎镇；藤城镇、潭东镇、津北镇三镇合并，设立藤州镇，2013年，新设宁康乡，至此，全县辖15个镇，2个乡。