北塔区之所以命名为北塔，缘于资江北岸的江北乡北塔村有一座北塔。塔始建于明代隆庆四年，塔高26米，八面七层，迄今为逾400余年历史。

北塔区具有悠久历史。自邵阳置郡以来，这里就商贾不断，一派繁荣。晋太康元年（280年），邵阳市前身——邵陵郡的郡治就设在今江北乡北塔湾。

1997年8月29日，国务院批复：撤销邵阳市东区、西区、郊区，调整设立邵阳市双清区、大祥区、北塔区。北塔区辖原东区的江北街道，原郊区的茶元头、江北、田江和从邵阳县划入的陈家桥乡，区人民政府驻江北大道资州。