1、犯罪的直接客体有所不同。前罪侵犯的是司法机关正常的诉讼活动。后罪侵犯的则是司法机关正常的刑事追诉和刑罚执行活动。2、犯罪客观方面的表现形式不同。前罪表现为以暴力、威胁、贿买等方法阻止证人作证或指使他人作伪证。后罪则表现为明知是犯罪的人而作假证明予以包庇。3、犯罪主观方面的要求不同。

一、包庇罪与妨害作证罪如何区分

妨害作证罪与包庇罪的区别，主要体现在以下几点：

1.犯罪的直接客体有所不同。虽然两罪的直接客体都是简单客体，但前罪侵犯的是司法机关正常的诉讼活动;后罪侵犯的则是司法机关正常的刑事追诉和刑罚执行活动。

2.犯罪客观方面的表现形式不同。前罪表现为以暴力、威胁、贿买等方法阻止证人作证或指使他人作伪证;后罪则表现为明知是犯罪的人而作假证明予以包庇。

3.犯罪主观方面的要求不同。妨害作证罪刑法条文对其主观方面未作出特别的强调。而包庇罪在主观方面有一点是刑法条文特别强调的，即行为人对于被包庇的对象必须明知其是犯罪的人，如果对此并不明知，而在客观上使犯罪人受到包庇的，不应构成包庇罪。

二、妨害作证罪客观要件

妨害作证罪在客观方面表现为行为人实施了采用暴力、威胁、贿买等方法阻止证人依法作证或者指使他人作伪证的妨害作证行为。

1、行为人非法劝止、阻止证人依法作证，具体可采用暴力方式如绑架等方法使证人人身自由受到严重限制甚至丧失自由而无法作证;或者以暴力作后盾对证人进行威胁使证人不敢作证;或者采用金钱、财物或其他利益，或许诺钱财或其他利益使证人不愿作证;或者采用引诱、唆使、劝说来说服证人不要作证：还有利用职务等身份迫使从属部下不要作证等等。无论采用何种方式，只要主观上具有故意，客观上实施了妨害证人依法作证的行为，妨害了司法机关的正常的诉讼活动，就构成妨害作证罪。证人是否被劝止或被阻止而没有作证，或者证人是否接受贿买的金钱、财物，对行为人构成犯罪没有影响。

2、行为人实施希望他人(不一定是证人)作伪证的行为。行为人具体可用胁迫的手段来实施，可以采用贿买的办法，也可以采用唆使、引诱的方法，还可以采用具他手段如利用职务迫使下属作伪证等。不管采用何种打法、手段，其实质都是一样的，即都是行为人希望他人作伪证，在客观上侵害了司法机关的诉讼活动，因此都是妨害作证的行为，行为人依法构成犯罪。在刑事案件侦查或审判过程中，辩护人、诉讼代理人以各种手段致使证人作伪证这种方式来妨害作证，如果构成犯罪的，应以妨害刑事证据罪论处。

关于妨害作证罪，对犯罪主体的身份并无特殊要求，只要符合一般主体的要件，那么都可以构成本罪。但实践中明确规定了，如果是司法工作人员犯妨害作证罪的话，按照《刑法》中的量刑规定要对其从重做出处罚。因此，这里司法工作人员的身份，只能算是加重处罚的一个影响因素，不能认为是定罪处罚的影响因素。