乙脑与流脑不是一回事。首先它们病变部位不伺，乙脑病变部位在脑实质；流脑病变部位在脑脊髓膜。其次乙脑是由乙脑病毒感染而发病；而流脑是由脑膜炎双球菌侵袭而致。第三，乙脑传播是由带毒蚊虫叮咬而感染；流脑是由空气传播的。第四，乙脑多发病于夏秋季节；流脑发病多在冬末春初。此外，乙脑在临床上还应与肠病毒性脑膜炎、单纯疱疹病毒性脑炎、结核性脑膜炎及中毒型菌痢相鉴别。