结核病治疗疗程结束时痰菌不能转阴，或在疗程中痰菌转阳，X线显示病灶未能吸收，说明化疗失败。其重要原因多为化疗方案不合理，未能规律用药或停药过早，或者细菌耐药，机体免疫力低下等。对于治疗失败病人需要另订方案，治疗复治病人，必须重新选择联用敏感药物。结核菌的药物敏感试验可以帮助选药，但费时长，一般数周才有结果，故临床上常用办法是根据病人过去详细用药情况，选出以往未用或少用的药物，我国结核病控制中心推荐了两个选择方案，可酌情选用，还可以选用一些较少使用的药物加以组合，例如卡那霉素、氨硫腺、丙硫异菸胺、卷曲霉素等。