体内生成ATP的方式有二，即氧化磷酸化和底物水平磷酸化，以前者为主要方式。

　　（一）底物水平磷酸化（substrate level phosphorylation）　底物分子中的能量直接以高能键形式转移给ADP生成ATP，这个过程称为底物水平磷酸化，这一磷酸化过程在胞浆和线粒体中进行。

　　（二）氧化磷酸化（oxidative phosphorylation）氧化和磷酸化是两个不同的概念。氧化是底物脱氢或失电子的过程，而磷酸化是指ADP与Pi合成ATP的过程。在结构完整的线粒体中氧化与磷酸化这两个过程是紧密地偶联在一起的，即氧化释放的能量用于ATP合成，这个过程就是氧化磷酸化，氧化是磷酸化的基础，而磷酸化是氧化的结果。