慢性腹泻可由于消化系统疾病、消化系统以外的慢性病变以及其他原因而引起，其中又以器质性疾病引起者居多。

　　其病因如下：

　　（1）消化系统疾病

　　1）肠原性慢性腹泻

　　①慢性肠道细菌感染性疾病

　　a慢性细菌性痢疾（慢性菌痢）

　　b溃疡型肠结核

　　c肠道菌群失调

　　②肠?a href='http://www.baiven.com/baike/224/293383.html' target='_blank' style='color:#136ec2'>兰纳娌?BR>
　　a慢性阿米巴痢疾

　　b肠鞭毛虫病

　　c结肠小袋纤毛虫病

　　d胃肠型黑热病

　　e慢性血吸虫病

　　f肠道蠕虫病

　　③原因未明的和其他原因的肠炎

　　a局限性肠炎，肉芽肿性肠炎

　　b慢性非特异性溃疡性结肠炎及所谓“慢性结肠炎”

　　c嗜酸粒细胞性胃肠炎

　　d放射性肠炎

　　④肠肿瘤

　　a结肠癌

　　b小肠恶性淋巴瘤

　　⑤肠吸收功能障碍

　　a“原发性”吸收不良综合征

　　b维普尔氏病（Whipple病）

　　2）胃原性慢性腹泻

　　3）胰原性慢性腹泻

　　4）肝胆疾病所致的慢性腹泻

　　（2）全身性疾病

　　1）内分泌、代谢障碍性疾病

　　①甲状腺功能亢进症

　　②慢性肾上腺皮质功能减退症

　　③垂体前叶功能减退症

　　④甲状腺功能减退症

　　⑤糖尿病性肠病

　　⑥类癌综合征

　　⑦凡莫二氏综合征

　　⑧水电解质平衡失常

　　2）尿毒症

　　3）糙皮病

　　4）药物性及食物过敏性慢性腹泻

　　5）低丙种球蛋白血症

　　6）免疫球蛋白A重链病

　　7）硬皮病

　　8）结肠激惹综合征（痉挛性结肠）

　　9）神经官能性腹泻