慢粒与原发性血小板增多症治疗及预后均不同，因此二者鉴别诊断很重要。骨髓涂片检查和染色体分析查找Ph染色体有助于二者鉴别，或者取骨髓或外周血行PCR扩增寻找有无Ph染色体的bcr\/abl基因来鉴别。