患根尖周炎的牙，病源多来自牙髓腔内感染坏死的牙髓，炎症位于较深的根尖组织。所以，治疗时视炎症的轻重缓急等情况不同，需要处理的次数也不一样。若炎症急重，要先钻开髓腔，摘除根管内感染坏死的牙髓组织，服用药物抗感染等。在炎症得到控制后，还须对根管进行扩挫和封药消毒，直至根尖病变得到控制，才能最后充填根管和牙齿，否则也会出现充填后疼痛，使病变继续存在。