扁平苔癣的治疗尚无满意的疗法。首先应消除精神紧张，治疗慢性病灶，生活力求规律。针对有关因素予以治疗。当损害局限且无糜烂时，用2%~4%碳酸氢钠溶液与0.2%洗必泰溶液交替冲洗，每日数次，并每月进行复查。发生局部糜烂事，局部糜烂区可敷复方类固醇粉，每日数次，甚者可用确炎舒松，注射于局部，每周2次，并加用抗生素。糜烂在唇红部位者，可用肤轻松软膏涂敷，每日数次。局部用抗霉菌治疗也有一定的作用，制霉菌素50万单位，口内含化，每日3~4次。全身用肾上腺皮质类固醇应慎重，施行小剂量、短程方案，如强的松5mg，每日3次，用1~2周，用药期间做大便潜血及血压检查。也可用昆明山海棠2片，每日3次；雷公藤片3~4片，每日2次。还可口服维生素A、维生素A酸。去除机械性刺激因素，刮除磨牙颊面的牙石，避免牙刷毛等刺伤局部粘膜也是非常重要的。
　　扁平苔癣大致与中医口蕈、口癣、口破、口疳等相似，多由热毒和湿毒积聚，或气滞血瘀，气血失和，湿热循经上逆，熏蒸于口，或肝郁血虚，化火上炎而致。证属脾胃湿热者，治以祛湿清热解毒，用平胃散合二妙散加减（苍术、厚朴、陈皮、薏苡仁、黄柏、夏枯草、土茯苓、藿香、佩兰、生甘草）。证属肝经实火者，治以清肝泻火，用龙胆泻肝汤加减（龙胆草、黄芩、栀子、柴胡、当归、车前子、生地黄、泽泻、木通、甘草）。证属肝气郁结者，治以疏肝理气解郁，用丹栀逍遥散或柴胡清肝汤加减（柴胡、当归、白芍、栀子、丹皮、茯苓、黄芩、川芎、香附、郁金、连翘、炙甘草）。证属血虚风燥者，治以滋阴养血、疏风润燥，用苔癣一号加减（当归、生地黄、白芍、熟地黄、麦冬、女贞子、枸杞子、白鲜皮、牛膝、香附、旱莲草）。证属阴虚内热者，治以滋阴清热，用六味地黄汤加减（生地黄、熟地黄、丹皮、茯苓、泽泻、山药、山茱萸、黄柏、知母、栀子、麦冬、旱莲草、天花粉、石斛）。证属气血两虚者，治以益气养血，用八珍汤加减（党参、黄芪、白术、茯苓、泽泻、当归、制黄精、白芍、熟地、何首乌、石斛）。证属气滞血瘀者，治以活血祛瘀，用血府逐瘀汤加减（当归、桃仁、红花、川芎、赤芍、柴胡、香附、生地黄、玄参、陈皮、甘草）。局部可用青黛、炉甘石、孩儿茶、冰片涂溃疡面；吴茱萸末醋调敷涌泉穴；还可用青吹口散、双料喉风散、解毒生肌散、柳花散、西瓜霜等中成药，撒于患处。可用金银花、玄参、生地黄煎水漱口。针灸治疗可起到辅助作用，取穴侠溪、中渚，耳针取神门、交感、皮质下及压痛点。