肾小管分泌主要在于排除体内的某些物质及调节血液的酸碱值。例如，当体内酸碱度过低时，肾小管会分泌H+与NH至滤液，使尿液呈酸性，排出体内过多的酸。H+的分泌在近曲小管、远端小管与集合管进行，NH的分泌在远端小管与集合管进行。