治疗非共同性外斜视首先要查明病因，针对病因进行治疗。用药物治疗时可选用肌注维生素B1、B12和三磷腺苷；糖皮质激素和抗生素对神经炎和肌炎有效；在展神经麻痹患者的恢复期间，于内直肌注射肉毒杆菌毒素A可暂时解除复视的干扰，防止或治疗内直肌痉挛。对于小于10△的斜视，可试用三棱镜中和法消除复视。当去除病因或已证实其不再复发时还可考虑手术治疗。