急性间质性肾炎的预后较好，除去病因，多能临床痊愈，一般肾小球功能先恢复，而后在数月内肾小管功能恢复正常（特别是在最初的6~8周），无远期不良影响。个别病例可演变为慢性间质性肾炎，遗留永久肾功能损害。慢性间质性肾炎的预后随病因及肾功能损害程度而异。病因能被彻底清除时，慢性间质性肾炎可以治愈。若已至发展慢性肾功能不全阶段，则预后不良。