由于根管内的复杂性，肉眼条件下进行根管清理非常困难；手术显微镜可以使术者直接了解其细微结构，更为有效地清理根管，同时可以在根管充填前了解根管的干燥程度和根管封闭剂在根管壁上的分布情况。手术显微镜可应用于所有牙髓根尖周病治疗过程中，其中在寻找根管口、钙化根管的疏通、根管治疗的再治疗、根管治疗意外的预防和处理等方面具有不可替代的优势。