有两种传统的药物可治疗禽流感：M2抑制剂（金刚烷胺和金刚乙胺）及神经氨酸酶抑制剂（OseltamivirandZanimivir）。这些药已在一些国家批准应用。但最近从越南死亡病例中分离出的毒株分析提示，H5N1病毒对M2抑制剂有抗药性。确认研究尚在进行，网络实验室也正在就神经氨酸酶抑制剂对H5N1的有效性进行研究。世卫组织对瑞士罗氏制药公司1999年研制出的口服抗流感药物达菲进行了检测，认定此药对预防禽流感或禽流感病毒传染到人体初期具有疗效。