进入人体的伤寒菌在巨噬细胞和胆囊内大量繁殖，并随胆汁再次进入回肠，侵袭致敏的淋巴组织，产生强烈的迟发性变态反应，引起回肠粘膜的坏死脱落，形成溃疡。溃疡面深而大、肠壁薄如纸，极易引起肠出血和肠穿孔。恢复期病人的全身症状减轻，食欲好转。而肠道溃疡面上新生肉芽组织还非常稚嫩，它的功能尚未完全恢复，所以大量饮食，容易导致肠出血、肠穿孔并发症的发生。