由于慢性淋巴细胞性甲状腺炎患者血中存在抗甲状腺抗体，甲状腺组织中有大量的淋巴细胞及浆细胞浸润和淋巴滤泡形成，部分患者可同时伴有其他自身免疫性疾病，因此目前认为慢性淋巴细胞性甲状腺炎是一种自身免疫性疾病。