此型为发生在角膜内皮的移植排斥反应。早期为淋巴细胞和浆细胞浸润，继之有许多形核白细胞浸润。这时在正常内皮和病变内皮之间出现一条白色浸润线，称为内皮排斥线。这种浸润可抵达后弹力层。内皮型排斥反应多从下方或有新生血管的部位首先发生，不断向上和中央扩展。皮质类固醇激素能迅速控制排斥反应，使植片保持透明。