厌氧菌存在于黏膜表面。氧化作用减少和黏膜表面破损可导致感染。其形成的角膜溃疡同一般细菌性角膜溃疡，角膜无特征性改变。产气荚膜梭状芽孢杆菌所致的角膜溃疡常在眼外伤后发生，初起为角膜浅层小溃疡，以后急速发展扩大，数小时后，基质浅层出现小气泡，有破裂倾向。