一般只在显微镜下方能看到的化石。微化石对石油地质工作者特别有用，因为它们体型小，钻头破坏不了。通常只有无脊椎动物，像有孔虫、放射虫、牙形石和介形类的遗骸，才能成为微化石。植物微化石主要是硅藻和其他某些藻类、孢子和花粉。极小的鱼鳞、鱼骨和鱼齿也可以成为微化石。绝大多数微化石都必须利用显微镜研究，但有些种，例如有孔虫的大型种，体径也可大到2.5—5厘米。