武侯是诸葛亮，但汉昭烈庙葬的是刘备，武侯祠只不过是一部分。纪念诸葛亮的武侯祠原本不在现址，而是位于今天锦里的东侧，汉昭烈庙位于今武侯祠。明献王朱椿入蜀以后，认为君臣的庙宇、祠堂平起平坐，有违礼教，因此将原武侯祠拆毁，并入了昭烈庙。但是老百姓更喜欢诸葛亮，所以仍然沿用武侯祠的叫法，久而久之，反倒没几个人知道汉昭烈庙了。因此到了民国时期，一位叫邹鲁的文人写了一首诗来说明这个问题：门额大书昭烈庙，世人都道武侯祠，由来名位输勋业，丞相功高百代思。