一般将玉米果穗装入特制的容仓内贮藏。容仓形状分长方形和圆形两种。长方形容仓离地垫起0.5-1.0米，长度以地形而定，宽不超过2.0米，用木杆或高粱秸等制成；圆形的底部垫起0.5米，直径2-4米，高3-4米，用荆条编制品或高粱秸围成。
贮藏时应注意，上部盖藏好，防止雨雪入仓，并选择地基干燥而通风的地点。仓与仓之间保持一定距离，以利通风。果穗水分含量低时，可及时脱粒，避免高湿季节果穗吸湿引起霉变或酸败。
如果入仓时果穗水分均匀，且在安全标准以内，一般不会出现发热霉变现象。入仓后应注意检查，一旦出现热湿，要及时倒仓降温、降湿。