近年来，纹枯病已经上升为水稻的最主要病害，并有四大特点：一是发生面广。二是抗纹枯病品种极少。三是危害程度日益严重，甚至造成穿顶倒伏。四是先由稻株下部发病，容易忽视而错过防治有利时机。在防治策略上严把四关是关键。
一、打捞菌核关　纹枯病主要以菌核的形态在稻田里越冬，越冬的菌核经过冬春到早稻插秧时，一般有60%～70%能发芽。绝大部分的菌核都比水轻，在长时间内能随水漂浮，稻田灌水后，捞除浮在水面上的菌核，能减少初次侵染的菌源，有效地减轻水稻前期发病率。捞除的方法是：在田面耙平以后，适当加深水层，然后用畚箕等工具把浮在下风的田边和田角水面上的浪渣和菌核捞起，挑离稻田，深埋或晒干烧毁。
二、肥水管理关加强肥水管理，提高秧苗抗病能力。在施肥策略上要掌握以下三条原则：一是重视基肥，多施农家肥和有机肥，一般基肥用量应占总施肥量的60%。二是氮、磷、钾三要素合理搭配，特别是氮肥施用不能过量。三是追肥要早、要适量，要按“前重、中控、后补”的原则追施。在管水上，实行浅、露、搁、活的灌溉方法，即在水稻分蘖阶段要实行浅水勤灌，适当露田；分蘖末期适度搁田，控制无效分蘖，抑制茎叶徒长；进入孕穗期后，应实行活水灌溉；到灌浆结实期则要坚持干干湿湿，促使秧苗生长清秀，无病到老。
三、毒土预防关　采用稻脚青霉土预防，能抑制纹枯病菌丝的生长和萌发。在水稻插秧后15―20天以内施完，亩用20%稻脚青250克拌细土25公斤，均匀撒入水稻田内，预防效果显著。但使用稻脚青时，一定要在孕穗期以前，禁止在孕穗期或生育后期使用。
四、药剂防治关　水稻纹枯病的发生一般前期发展较慢，后期上升较快。因此，在早稻分蘖盛期应力口强田间调查，当遇到高温高湿天气，田间病蔸率在30%左右时就应立目口用药防治，以控制病害的危害蔓延。药剂可选用井岗霉素粉剂每亩一包或井岗霉素水剂0．2公斤兑水50公斤，并根据发病程度和天气情况，连喷2～3次。喷药应着重喷在稻株的中下部，才能收到良好的效果。