崧厦镇古称嵩下市。据《上虞县志》与《崧厦志》记载，晋隆安四年（公元400年），吴国内史左将军袁崧为御孙恩筑城，次年袁崧兵败殉职，后人为纪念袁崧，称其所筑之城为“嵩城”，并为其建造忠介袁公祠。后嵩城及袁公祠年久废弃。宋嘉定七年（公元1214年），里人重建袁公祠于现址。祠北有街名嵩下市（见明倪元璐嵩城庙碑记）。袁公祠俗称嵩城庙，解放前后一直称为崧城庙。清朝以后的地方志中嵩下市逐渐改为嵩城市、嵩镇、嵩厦街、松厦镇、崧厦镇等字样。

1936年版的《中国古今地名大辞典》中记载为崧厦镇，至解放初已不见有别名出现，统一称为崧厦镇。崧厦于1949年5月解放，6月建立红色政权崧厦镇人民政府。

1956年5月改组为镇人民委员会，1958年为崧厦人民公社城镇大队（不久即改为城镇管理区），1959年恢复镇人民委员会，1961年又与崧厦公社合并成立崧厦镇人民公社，1965年与崧厦公社分开，恢复崧厦镇人民委员会，1968年改称崧厦镇革命委员会，1981年恢复崧厦镇人民政府。

1992年4月撤区并乡扩镇，原联丰乡、华镇乡、新建乡、崧厦镇合并，重新组建崧厦镇人民政府。2001年11月，根据市委，市府的区域调整规划，又将沥东镇的四埠片、三联片（即原四埠乡、三联乡）划给崧厦管辖。现今的崧厦镇范围，实际就是原来的一镇五乡。