张江自成陆以后,唐、宋时代已设乡里之治,明、清时期地方有保图建制。按地置治,迄今已逾千年。唐天宝十载(751年)置华亭县,长人乡即属之华亭(现镇域为长人乡一部)。元至元十四年(1277年)华亭升格为府。至元二十九年(1292年),析华亭东北境的长人、高昌、北亭、新江、海隅五乡置上海县后,现镇域随长人乡被划归上海县管辖直至清代。
清雍正四年(1726年),长人乡大部由上海县析出建置南汇县,张江由是转属南汇县治下的二十保、十七保。嘉庆十年(1805年),朝廷准奏割上海县高昌乡、南汇县长人乡以及下沙盐场八九两团等地区设川沙抚民厅,然张江大部地区仍属南汇县辖地,唯孙桥一小部划归川沙抚民厅治下。
至民国初,南汇县实行市(镇)乡制,将全县划为2市(镇)17乡,张江境域属远北市。
民国18年(1929年),国民政府颁布新组织法,调整原有行政区划,张江大部属南汇县第七区,其敦仁、秦镇、殷乐、新兴、集贤、市东、古桐、临安、仙吕、求知等乡俱属第七区远北市辖,唯横沔港以东为川沙县第二区治下。
民国23年(1934年),南汇县、川沙县又先后调整区划,张江地区转属南汇县第四区,孙桥部分地区为川沙县第一区。
1937年抗日战争爆发,南汇、川沙相继沦陷。
1940年,川沙县代管张江栅镇和陈水关桥乡、横沔乡。
1942年,汪伪政权扩大上海市辖区,建立上海特别市,川沙、南汇从江苏省析出,分建川沙、南汇区署,归上海特别市辖,张江栅置镇并成立维持会隶南汇县。
1945年9月抗日战争全面胜利后,重新恢复抗战前原有行政隶属关系,张江地区随川沙、南汇两县仍归属江苏省。
民国35年(1946年)2月,南汇县再次调整行政区划,张江区(第四区)辖远北、立德、御桥、都台、回澜及张江共六乡。同年5月,川沙县三王乡、曹河乡撤并为三河乡(孙桥地区的三灶、四灶属三河乡辖地)。
1948年8月,三河乡划归城厢镇。
1949年10月1日中华人民共和国成立。同年11月建立北蔡区人民政府。区政府驻地张江栅西钱家天主堂浜南。
1950年北蔡区由南汇县划归川沙县。时张江地区有张江、殷浜、马浜、新桥、三桥、新立等乡(三灶、四灶两乡自1954年从城厢镇划归北蔡区)。
1957年7月“撤区并乡”,张江、三桥、新桥、新立、马浜五个小乡撤并为张江乡,殷浜、三灶、四灶等撤并为殷浜乡。
1958年9~10月间,殷浜乡、张江乡先后成立红光和卫星人民公社。同年11月,红光、卫星和东风人民公社(含北蔡、花木)又撤并为张江人民公社。是年12月,国务院调整行政区划,将原属江苏省的川沙、南汇等七县划归上海市,张江公社、孙小桥公社随之归入上海市川沙县版图。
20世纪50年代末60年代初,张江地区的行政区划又多次小范围变动,一部分划入城厢镇,一部分析归唐镇,另有三桥、明星、公民、砖桥等转隶属金桥。
1984年4月,政社分设重新成立乡人民政府时,张江乡和孙小桥乡分别辖12个和13个行政村。
1993年1月1日,撤川沙县成立浦东新区,两乡随之属浦东新区辖。同年5月5日,孙小桥乡更名为孙桥乡。
1995年12月撤乡建镇,张江、孙桥两乡同时变更为张江镇和孙桥镇。2001年11月,张江、孙桥“撤二建一”,成立新的张江镇。至此,张江镇成为浦东新区13个镇级行政机构之一。