农业生态系统是在人类活动干预下，农业生物与其环境之间相互作用形成的一个有机综合体。也可以简单地概括为：农业生态系统=农业生物系统+农业环境系统+人为调节控制系统。农业生态系统既包括生物和非生物，又包括人为调节控制系统（即人类农业生产活动和社会经济条件）；经济因素和社会因素是整个农业生态系统中十分重要的内容。因此，农业生态系统是一个社会-经济-自然复合生态系统，属于半自然的人工生态系统。需要指出的是，农业生态系统的“农业”指包括农、林、牧、副、渔、菌、虫及微生物的大农业。