《工商行政管理机关股权出质登记办法》适用于以持有的有限责任公司和股份有限公司股权出质，办理出质登记的情况。但是，已在证券登记结算机构登记的股份有限公司的股权，不再适用《工商行政管理机关股权出质登记办法》。