审查起诉行政公益诉讼的时效是检察建议回复期满之日起两个月内。检察建议回复期满后，行政机关没有纠正违法行为或者没有依法全面履行职责，或者没有回复，检察院可以向法院提请诉讼，这个时候，检察院的身份是公益诉讼发起人。

一、审查起诉行政公益诉讼的时效是多久?

检察建议回复期满后，行政机关没有纠正违法行为或者没有依法全面履行职责，或者没有回复，国家利益或者社会公共利益持续处于受侵害的，检察机关以公益诉讼起诉人的身份依法提起行政公益诉讼。经过诉前程序，应当制作《起诉审查报告》，提出具体处理意见，集体讨论后，报经检察长决定。检察长认为有必要的，可以提请检察委员会讨论。拟决定向人民法院提起行政公益诉讼的，应当在检察建议回复期满之日起两个月内办理终结。有特殊情况需要延长的，报经检察长决定。

省级人民检察院可以根据本地情况，建立拟起诉案件审批、备案制度。对于重大、疑难、复杂的公益诉讼案件，可以按照《人民检察院案件请示办理工作规定(试行)》的相关规定向最高人民检察院请示。拟决定不提起诉讼的，应当制作《终结审查决定书》，并在七日内发送行政机关。

二、检察院提请公益诉讼审查哪些内容?

1、审查内容。检察机关审查行政公益诉讼案件，应当查明：行政机关的法定职责、权限和法律依据;行政机关违法行使职权或者不作为的证据;国家利益或者社会公共利益受到侵害的事实及状态;行政机关违法行使职权或者不作为与损害后果之间存在因果关系;其他需要查明的内容。

2、讨论及审批程序。行政公益诉讼案件由检察官办案组办理。审查终结的，应当制作《诉前审查报告》并明确提出是否发出检察建议或终结审查的处理意见，并经集体讨论。集体讨论形成的意见，应当报检察长决定。检察长认为必要的，可以提请检察委员会讨论决定。

3、审查期限。办理行政公益诉讼案件拟作出终结审查或者提出检察建议决定的，应当自决定立案之日起三个月内办理终结。有特殊情况需要延长的，报经检察长决定。检察机关办理行政公益诉讼案件，鉴定、评估、审计期间及报送审批期间不计入审查期限。

综上所述，检察院在平时工作中发现政府机构有违法行为，其可以提出检查意见，如果政府机构没有处理，在回复期满后两个月内，检察院应该发起行政公益诉讼。检察院审查的时候，重点看政府机构行为和公共利益受损之间是否有必然联系。