公安机关及人民检察院；只要触犯了职务犯罪就会由当地的公安部门立案侦查，从而确定有犯罪的事实就可以交由检察院处理，人民检察院审查终结的案件，就应当作出提出公诉或者是不起诉的决定。

一、职务犯罪的侦查机关是哪个机关

职务犯罪的侦查机关是公安机关、人民检察院。公安机关或者人民检察院发现犯罪事实或者犯罪嫌疑人，应当按照管辖范围，立案侦查。人民检察院侦查终结的案件，应当作出提起公诉、不起诉或者撤销案件的决定。

《中华人民共和国刑事诉讼法》

第一百一十五条　公安机关对已经立案的刑事案件，应当进行侦查，收集、调取犯罪嫌疑人有罪或者无罪、罪轻或者罪重的证据材料。对现行犯或者重大嫌疑分子可以依法先行拘留，对符合逮捕条件的犯罪嫌疑人，应当依法逮捕。

第一百六十五条　人民检察院直接受理的案件中符合本法第八十一条、第八十二条第四项、第五项规定情形，需要逮捕、拘留犯罪嫌疑人的，由人民检察院作出决定，由公安机关执行。

二、刑事案件处理的流程是怎么样的

1、刑事拘留刑事拘留通知，公安机关对被拘留的人，应当把拘留的原因和和羁押的处所，在24小时内以内通知被拘留人的家属或者他的所在单位。

2、刑事拘留刑事拘留通知，公安机关对被拘留的人，应当把拘留的原因和和羁押的处所，在24小时内以内通知被拘留人的家属或者他的所在单位。

3、审查批捕公安机关提请检察院批捕，检察院会在收到案件材料后7天内决定是否批捕。如果检察院认为不构成犯罪，则不予批捕，在押人员应该释放。如果批捕了，则案件进入侦查阶段。

4、侦查阶段：批捕后，案件退回到公安机关，由派出所或者预审大队继续侦查案件情况。

5、审查起诉检察院收到公安机关送来的案卷后，审查当事人是否构成犯罪，认为证据确凿，事实清楚，构成犯罪的，在1个月内移送法院起诉。

6、开庭审理法院在收到检察院的起诉材料后，会在2-3天内立案，1个月内开庭审理，判处刑罚或者无罪判决。法院审理公诉案件，应当在受理后一个月内宣判，至迟不得超过一个半月。

职务犯罪的行为是会让公司的利益受损，只要触犯了刑事法条就可以由公安机关或者是人民检察院进行侦查，只有确定有犯罪的情形才可以让违法者承担刑事责任，一般在处罚时就会按犯罪的结果来进行判定，职务犯罪一般涉及到的罪名有贪污罪、受贿罪、挪用公款罪等等。