盐碱地区水稻育苗主要影响因素是盐碱为害，水稻立枯病和水稻烂秧、恶苗病等也相对较重。因此，搞好水稻育苗床土的调配，做好可能发生病害的预防工作，控制好温度水分，对育苗之成败尤为重要。
1、种子消毒2006年春季由于在水稻浸种期间气温较低，加之某些品种恶苗病生理小种发生变化，因此有些常规浸种药剂消毒效果较差，恶苗病发生比较普遍。针对这一情况，将恶苗净加入渗透剂，调整助剂成分，使得恶苗净防恶苗病效果达到99%以上；而且壮苗、生根、分蘖效果明显。100克恶苗净可浸种40公斤，常温室温浸种都可以，一般浸5～7天就可催芽播种。
2、置床处理盐碱地育苗，苗床地要选择地势较高且平坦，背风向阳，有水源地方做床。置床做成申沟高床，利于盐碱下渗、排洗。苗床地最好在头一年上冻前深翻10厘米，加入适量的农家肥搂匀，盖上稻草过冬。春季播种前将二铵或复合肥撒在床面上，施用量为每平方米30～50克，用耙子搂匀耙平，再用1000倍液硫酸水浇透，待床面水渗干后在上面铺隔离层。隔离层可以就地取材，如稻壳、废编织袋、打孔地膜，或者用简塑盘、抛秧盘、软盘等。
3、营养土的配制取盐碱比较轻的旱田土（没施旱田除草剂的）、山皮土均可。用5毫米筛子过筛，加入30%有机肥或草碳土，再加入水稻育苗营养剂，如吉新药肥酸混剂、育苗宝、壮苗精、三功能调理剂等。每袋可拌200～250公斤床土，育苗100～120盘。混拌均匀后的营养土即可平铺在隔离层上或装入盘中待播种用。
4、浇水播种营养土装盘铺平后，用1000～1500倍硫酸水浇床面，之后播种。种量不能过大。每平方米250～300克种子为宜。
5、覆土、撒苗床除草剂播完种子后用拌有营养剂的床土盖种，厚度1厘米为宜。再将苗床封闭除草剂-护秧，对细土或细沙混拌均匀撒在床面上，即可盖地膜和扣膜。护秧每袋50克，盘育苗可处理20平方米，抛秧盘可处理30平方米。
6、防立枯病秧苗1.5个叶前浇立枯一次净或枯必净，每袋可处理40平方米苗床。秧苗2.5叶（离乳期）以后，如果秧苗徒长，根系不好，易得立枯病，在发病初期可用立枯一次净或枯必净兑水浇在发病处，3～5天即可发出新根长出新叶。这个期间如果床面返碱严重，可浇1次2000～2500倍酸化水。
7、追肥秧苗在2.5叶以后，根据秧苗颜色适当追施硫氨，每平方米施50～60克。
8、注意事项播种前置床和床面必须浇透水，出苗后2叶前尽量少浇水，不干不浇水。主要是控制上部徒长，促进根系发育。苗出齐后要及时抽掉地膜，棚内温度不能超过30摄氏度，晴天高温要及时通风，避免高温烧苗。2.5叶以后温度控制在25摄氏度以内，棚内要大通风，并及时浇水。